教育部
- 教育部就「教牧及信徒培訓組」、「神學教育組」、「聖樂促進組」及「性文化關注組」四大範疇策動事工：
- 「教牧及信徒培訓組」舉辦教牧及長執專業培訓、基督教通識教育課程及青年領袖事工研討會等，使教牧長執及信徒得到造就，擴闊信仰的視野。
- 「神學教育組」跟進本地神學教育事工，設立「香港華人基督教聯會神學獎學金」鼓勵信徒完成造就，委身堂會牧養或宣教事奉；「支持本地神學教育」專款資助本港神學院校之教育工作。
- 「聖樂促進組」舉辦多項聖樂講座，凝聚聖樂事奉人員及教牧同工交流教會聖樂牧養經驗。自2018年成立「聯會詩班」，詩班員來自不同堂會，在聯會多次聚會中負責獻詩。
- 「性文化關注組」一直關注本港性文化及同性婚姻有關議題，舉辦講座、研討會等，培育新一代青少年有辨解能力，能靠真理抵禦情慾橫流的世代。